RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 POLR1DQ9Y2S0 133 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 FIS1Q9Y3D6 152 aa2.34□□□□□ -2.03
SHQ1-208ENST00000482785 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
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SHQ1-208ENST00000482785 MFNGO00587 321 aa2.33□□□□□ -2.04
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SHQ1-208ENST00000482785 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa2.33□□□□□ -2.04
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SHQ1-208ENST00000482785 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa2.32□□□□□ -2.04
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SHQ1-208ENST00000482785 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 VCX3BQ9H321 246 aa2.32□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 BCL2L10Q9HD36 194 aa2.32□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
SHQ1-208ENST00000482785 CALML5Q9NZT1 146 aa2.32□□□□□ -2.04
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