RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.96□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.96□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.95□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.95□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.94□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.94□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.94□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 U3KQE9 123 aa9.94□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 H3BRN7 92 aa9.93□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 VSIRQ9H7M9 311 aa9.93□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 COL6A5A8TX70 2615 aa9.92□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PPV4 95 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 HELTA6NFD8 242 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 ZNF98A6NK75 572 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 CHEK1O14757 476 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 IFNA7P01567 189 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 CSN3P07498 182 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 FOLR2P14207 255 aa9.91□□□□□ -0.82
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NISCH-208ENST00000481211 CD33P20138 364 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 MEOX2P50222 304 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 SULT1A2P50226 295 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RPRMQ9NS64 109 aa9.91□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RAB2AP61019 212 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 KHDC3LQ587J8 217 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 TEX261Q6UWH6 196 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 RNF141Q8WVD5 230 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.9□□□□□ -0.82
NISCH-208ENST00000481211 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-208ENST00000481211 TEX46H3BTG2 121 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-208ENST00000481211 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NISCH-208ENST00000481211 GALR1P47211 349 aa9.89□□□□□ -0.83
NISCH-208ENST00000481211 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.89□□□□□ -0.83
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