RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478076.5

FAM107B-217, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene FAM107B, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-217	ENST00000478076	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076		K7EMT4	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	LGALS9	O00182	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	BMPR1B	O00238	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	HYPM	O75409	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ZP3	P21754	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	CRYBB3	P26998	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	GPR183	P32249	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ARL3	P36405	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TAS2R45	P59539	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	RAB2A	P61019	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076		U3KQE9	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076		A0A1W2PPV4	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076		A8MWP6	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076		H3BRN7	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	PPT1	P50897	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	DEFA5	Q01523	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	FHL3	Q13643	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	GPR82	Q96P67	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076		S4R3C0	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FAM107B-217	ENST00000478076	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	LINC01619	G3V211	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	CXorf1	O96002	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	IL4	P05112	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	ORM2	P19652	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	NPPC	P23582	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	PSMB3	P49720	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	FHIT	P49789	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	LYZ	P61626	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	METTL26	Q96S19	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076		A0A1W2PS18	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAM107B-217	ENST00000478076	BUB3	O43684	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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