RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471471.1

GTF2B-205, Transcript of general transcription factor IIB, human

TSL 3

Gene GTF2B, Length 516 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF2B-205	ENST00000471471	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	METTL26	Q96S19	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HELT	A6NFD8	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	RGS5	O15539	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	BUB3	O43684	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NXPH3	O95157	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	TOMM40	O96008	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NPPC	P23582	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NPY1R	P25929	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	TFPI2	P48307	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	RND2	P52198	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DEFB131A	P59861	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SRPX	P78539	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471		H3BMQ9	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	PITX3	O75364	302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	OR10J1	P30954	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	CCR6	P51684	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	IL18	Q14116	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471		V9GYH0	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SOCS3	O14543	225 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	IL4	P05112	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SLC25A6	P12236	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HAMP	P81172	84 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	ZNF79	Q15937	498 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	STH	Q8IWL8	128 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471		U3KQ87	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GTF2B-205	ENST00000471471	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471		A8MTW9	85 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	PSG1	P11464	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	TNFSF8	P32971	234 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	PAX9	P55771	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	DHRS2	Q13268	280 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	ICAM4	Q14773	271 aa		4.52	□□□□□ -1.69
GTF2B-205	ENST00000471471	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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