RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467613.5

UBP1-208, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 5

Gene UBP1, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-208	ENST00000467613		U3KQE9	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613		K7EMT4	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	CRYBB3	P26998	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613		Q6ZRG5	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613		Q8WTZ3	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	PFDN5	Q99471	154 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	RNF2	Q99496	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613		A0A087WW49	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	LINC01619	G3V211	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613		H3BRN7	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	HYPM	O75409	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	IL4	P05112	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	NMB	P08949	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	ZP3	P21754	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	FHIT	P49789	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	RAB2A	P61019	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBP1-208	ENST00000467613	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	BUB3	O43684	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MYCNOS	P40205	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RHOB	P62745	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	SORL1	Q92673	2214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CCL24	O00175	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	GP9	P14770	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	ORM2	P19652	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	S100A7	P31151	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
UBP1-208	ENST00000467613	LYZ	P61626	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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