RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 TMBIM6P55061 237 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PSG9Q00887 426 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RSG1Q9BU20 258 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RPRMQ9NS64 109 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 RFNGQ9Y644 331 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM189A5PLL7 270 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A5P33763 92 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GALR1P47211 349 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 INPP1P49441 399 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMB3P49720 205 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 AP3S2P59780 193 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 AKR1C1Q04828 323 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM78BQ5VT40 261 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1-204ENST00000459646 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BMQ9 156 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 H3BP45 60 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNGR2O43760 224 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 HBE1P02100 147 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TRGV9Q99603 122 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DOK5Q9P104 306 aa6.14□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF98A6NK75 572 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ISLRO14498 428 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 AMBPP02760 352 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 S100A7P31151 101 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 MEOX2P50222 304 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DAD1P61803 113 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 RRN3P1Q2M238 152 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 NEU1Q99519 415 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0J9YX75 114 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PITX3O75364 302 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SFT2D2O95562 160 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SCGB1D2O95969 90 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 IL5P05113 134 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 OR5G3P0C626 314 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 HTN1P15515 57 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 RAP2BP61225 183 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 RHOBP62745 196 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R1AQ13522 171 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF182Q8N6D2 247 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 THAP8Q8NA92 274 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 C20orf173Q96LM9 149 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SOSTQ9BQB4 213 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PSENENQ9NZ42 101 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DKK2Q9UBU2 259 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 M0R2Z0 102 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 SOCS3O14543 225 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 PRM2P04554 102 aa6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB130BP0DP73 79 aa6.11□□□□□ -1.43
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