RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-218	ENST00000449489	ATP5H	O75947	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	GNG2	P59768	71 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	INS	P01308	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	RLN1	P04808	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	PSMB9	P28065	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	ETV6	P41212	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	FXYD4	P59646	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DEFB1	P60022	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	HAMP	P81172	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	FCN2	Q15485	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		Q6ZSA8	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DOK5	Q9P104	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	SLC25A4	P12235	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	AZU1	P20160	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OPRK1	P41145	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TAS2R60	P59551	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	FABP5	Q01469	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DHODH	Q02127	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR5I1	Q13606	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		A0A0B4J293	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	GPR31	O00270	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TOMM40	O96008	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	PRM2	P04554	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	IL4	P05112	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	PTHLH	P12272	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	RAB3B	P20337	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR10J1	P30954	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	CBX5	P45973	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	MEOX2	P50222	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR10A3	P58181	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	HERV-K104	P61576	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		A0A096LPF7	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		A0A0A6YYH2	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		A0A0J9YY99	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		A6NJ64	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489		F6UB75	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-218	ENST00000449489	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms