RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 UBE2CO00762 179 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SCGB2A1O75556 95 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 S100A11P31949 105 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 MLANAQ16655 118 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V0BQ99437 205 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SMCO3A2RU48 225 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 PRSS46E5RG02 174 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 BCL2L11O43521 198 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SPRY2O43597 315 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 OPCMLQ14982 345 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YWU9 116 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 CLN5O75503 358 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RND2P52198 227 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 DLK1P80370 383 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 STPG3Q8N7X2 389 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ACY3Q96HD9 319 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SLC35E1Q96K37 410 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ATP5SQ99766 215 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 GINS3Q9BRX5 216 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 WFDC1Q9HC57 220 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TAAR5O14804 337 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 DFFBO76075 338 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 C8orf88P0DMB2 117 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 C4BPBP20851 252 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 AKR1C1Q04828 323 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1FQ16864 119 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TIGITQ495A1 244 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 OR4X1Q8NH49 305 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 K7EMT4 169 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 OR10J1P30954 320 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TFPI2P48307 235 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ZNF266Q14584 549 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SMPXQ9UHP9 88 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 CHEK1O14757 476 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 IFNA5P01569 189 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 FGF7P21781 194 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 TCTAP57738 103 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 GAMTQ14353 236 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 VWC2Q2TAL6 325 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 DEFB135Q30KP9 77 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 NPIPB3Q92617 1050 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 RNF2Q99496 336 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 GGACTQ9BVM4 153 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-210ENST00000442481 OR4C46A6NHA9 309 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 FNDC10F2Z333 226 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 IGLC1P0CG04 106 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 TCF24Q7RTU0 167 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 SLC51BQ86UW2 128 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 Q8WTZ3 238 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 ST8SIA2Q92186 375 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-210ENST00000442481 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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