RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 LCE6AA0A183 80 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 BMPR1BO00238 502 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 RD3LP0DJH9 198 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 SPP1P10451 314 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PSG1P11464 419 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 B2MP61769 119 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PRR20EP86478 221 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PRR20CP86479 221 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PRR20DP86480 221 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PRR20BP86481 221 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PRR20AP86496 221 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 MIC13Q5XKP0 118 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 Q8WTZ3 238 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 TM2D3Q9BRN9 247 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 RFNGQ9Y644 331 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 IGLV1-51P01701 117 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 SEC11BP0C7V7 166 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 LINC00869P0C866 280 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 SERF2P84101 59 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 Q8N1Y9 231 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.42□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 ZP3P21754 424 aa9.41□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 RPEL1Q2QD12 228 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZRG5 221 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 NDUFA4O00483 81 aa9.4□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 MBP02144 154 aa9.4□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 LYZP61626 148 aa9.4□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.4□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 RNF125Q96EQ8 232 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-208ENST00000438888 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.4□□□□□ -0.9
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PRAME-208ENST00000438888 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.39□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 DOK5Q9P104 306 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 LYSTQ99698 3801 aa9.39□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 IFNA7P01567 189 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 OR5G3P0C626 314 aa9.38□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 M6PRP20645 277 aa9.38□□□□□ -0.91
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PRAME-208ENST00000438888 HAGHQ16775 308 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-208ENST00000438888 VSIRQ9H7M9 311 aa9.38□□□□□ -0.91
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