RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 OCC1Q8TAD7 63 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SELENOTP62341 195 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ECSCRQ19T08 205 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DRB5Q30154 266 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 B5MCH6 92 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 B9A039 149 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SORL1Q92673 2214 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TM4SF20Q53R12 229 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CENPWQ5EE01 88 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TMUB1Q9BVT8 246 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC21A0A140T8X8 626 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 IFITM10A6NMD0 228 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 H0YJW9 148 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF137PP52743 207 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 MUC21Q5SSG8 566 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PAXXQ9BUH6 204 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LHBP01229 141 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV1-8P0DP01 117 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 AZU1P20160 251 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 VSTM2AQ8TAG5 236 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 KLRB1Q12918 225 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF841Q6ZN19 808 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 VKORC1Q9BQB6 163 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SNURFLB1AK76 121 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TIMM23O14925 209 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PGPA6NDG6 321 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SHISA9B4DS77 424 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 DLL1O00548 723 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 HTR1DP28221 377 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPB8Q9UJY1 196 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 NPPCP23582 126 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PAX2Q02962 417 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 P2RX4Q99571 388 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PAFAH1B2P68402 229 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PRCDQ00LT1 54 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 VCX2Q9H322 139 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 A1L4Q6 167 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 WT1-ASQ06250 92 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 MORN5Q5VZ52 161 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PET117Q6UWS5 81 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5B3Q8NH48 314 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV2-5P01817 119 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SSX8Q7RTT4 187 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 MPDU1O75352 247 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SAP30O75446 220 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 PDPNQ86YL7 162 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CSN3P07498 182 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 ESDP10768 282 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 COX11Q9Y6N1 276 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CGB1A6NKQ9 187 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 RBX1P62877 108 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP37Q8NFH4 326 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM250H0YL14 139 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 CORTO00230 105 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf88P0DMB2 117 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 FA2HQ7L5A8 372 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 LINC01551Q86U37 167 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms