RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 PSENENQ9NZ42 101 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 VAX2Q9UIW0 290 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 HERC1Q15751 4861 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SMCO3A2RU48 225 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 H3BQ15 152 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SIGLEC5O15389 551 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SSSCA1O60232 199 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 YPEL1O60688 119 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 NXPH2O95156 264 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HAND1O96004 215 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 APOHP02749 345 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CGB3P0DN86 165 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CGB7P0DN87 165 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 PSG2P11465 335 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HTR1DP28221 377 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 KIR2DS2P43631 304 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CCL20P78556 96 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF9Q07011 255 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 Q3ZCU0 254 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 STUMQ69YW2 141 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SSX9Q7RTT3 188 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR51H1Q8NH63 302 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 YPEL2Q96QA6 119 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 IMMP2LQ96T52 175 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RPRMQ9NS64 109 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0G2JRQ6 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf90A8MZG2 172 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 EPM2AB3EWF7 344 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C15orf65H3BRN8 121 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 M0R036 132 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CDIPTO14735 213 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 AGPAT2O15120 278 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SPINT2O43291 252 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CST7O76096 145 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR2C1O95371 312 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HPRT1P00492 218 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 S100A6P06703 90 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 FAM106CPP0CH98 169 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 BCL2P10415 239 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CCL3L1P16619 93 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 S100PP25815 95 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 PSMB3P49720 205 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 FHITP49789 147 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 B2MP61769 119 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 POU2AF1Q16633 256 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM21Q3B7S5 101 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C14orf177Q52M58 125 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 WDR82Q6UXN9 313 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CORO2AQ92828 525 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C18orf15Q96N68 181 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 GAFA1Q96PS6 74 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 MANBALQ9NQG1 85 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CACNG5Q9UF02 275 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 JPT1Q9UK76 154 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ODF3BA8MYP8 253 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CYB5BO43169 146 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF737O75373 536 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HBZP02008 142 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 GPR12P47775 334 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR3A1P47881 315 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RAB7AP51149 207 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SPCS3P61009 180 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ELOBQ15370 118 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C12orf57Q99622 126 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RARRES2Q99969 163 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms