RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.03■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF492Q9P255 531 aa15.03■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.03■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 CRYGCP07315 174 aa15.02■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 CSN3P07498 182 aa15.02■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 RNF151Q2KHN1 245 aa15.02■□□□□ -0
NEFHP1-201ENST00000412845 KALRNO60229 2985 aa15.02□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.02□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CHEK1O14757 476 aa15.02□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM191AQ9H0A3 160 aa15.02□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SCRT2Q9NQ03 307 aa15.02□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXE3Q13461 319 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TMUB1Q9BVT8 246 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TRGV9Q99603 122 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ASCL2Q99929 193 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 RNF24Q9Y225 148 aa15.01□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PCNX1Q96RV3 2341 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CBY3A6NI87 242 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 OVOL3O00110 214 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 APOHP02749 345 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CD40P25942 277 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 LYPD2Q6UXB3 125 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 COL8A1P27658 744 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 RHOGP84095 191 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 DEFB109BQ30KR1 87 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 Q86TA4 180 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa15□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A087X0K7 114 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 LIPFP07098 398 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 DEFB125Q8N687 156 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF785A8K8V0 405 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CNTFRP26992 372 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PRNTQ86SH4 94 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM186Q96B77 213 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 MGAQ8IWI9 3026 aa14.99□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 IGLV2-11P01706 119 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PSG1P11464 419 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 DLX1P56177 255 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PET117Q6UWS5 81 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 HAX1O00165 279 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ZZEF1O43149 2961 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.97□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 OR5AL1P0C617 328 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 HTR1DP28221 377 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 LYZP61626 148 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 SNAI2O43623 268 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TEX45Q8NA69 505 aa14.96□□□□□ -0.01
NEFHP1-201ENST00000412845 TNFRSF1AP19438 455 aa14.96□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.96□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.96□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CTSZQ9UBR2 303 aa14.96□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM231BA6NCW3 169 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 NCR2O95944 276 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 LINC00311Q8N616 119 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CCL17Q92583 94 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 C17orf100A8MU93 164 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 LINC01545Q5VT33 79 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CST9LQ9H4G1 147 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 OTORQ9NRC9 128 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.95□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.94□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.94□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PPIAL4DF5H284 164 aa14.94□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 HLA-DRB1P01911 266 aa14.94□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.94□□□□□ -0.02
NEFHP1-201ENST00000412845 ADIPOQQ15848 244 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.1 ms