RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMCO3A2RU48 225 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4C46A6NHA9 309 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPEO14579 308 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HBZP02008 142 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R41P59536 307 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFA1P59665 94 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMC5P62195 406 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUFY3Q7L099 469 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARPINQ7Z6K5 226 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4K17Q8NGC6 315 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10D3Q8NH80 312 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC9Q8WXX5 260 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf72Q96LT7 481 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMC7Q9H6L4 198 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT46Q9NQC8 304 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 BET1LQ9NYM9 111 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 S4R3F8 94 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA3Q08378 1498 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 RREB1Q92766 1687 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRN3E7EW58 273 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCR6O00574 342 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCA1CO95843 209 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX4I1P13073 169 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACYP2P14621 99 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1DQ13901 141 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNA13Q14344 377 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM141Q96I45 108 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00467Q9BRT7 94 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 CENPKQ9BS16 269 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPPP3Q9BW30 176 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3orf18Q9UK00 162 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAPPAQ13219 1627 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PRQ8 180 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R036 132 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 LST1O00453 97 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 STOMP27105 288 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB110Q30KQ9 67 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 PID1Q7Z2X4 250 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB123Q8N688 67 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM109Q9BVC6 243 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX6Q9UNH7 406 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 C17orf112F2Z3M2 114 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0Y980 276 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCRL2O00421 344 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4E1P0C645 316 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGTR1P30556 359 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTL10Q5JWF8 245 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM122BQ7Z309 247 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HDDC3Q8N4P3 179 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPC24Q8NBT2 197 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 CATSPER2Q96P56 530 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPXQ9BT56 116 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 NINJ2Q9NZG7 142 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A13Q9Y226 551 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ROBO3Q96MS0 1386 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf170A2RU37 121 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0YCG3 227 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL6IP5O75915 188 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASS1P00966 412 aaKnown RBP-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCRBP04435 133 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BOP23527 126 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABRR2P28476 465 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMOX2P30519 316 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BBP33778 126 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 SULT1A1P50225 295 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BDP58876 126 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BCP62807 126 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 FABP5Q01469 135 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUCB1Q02818 461 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAJC3Q13217 504 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST2H2BEQ16778 126 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 RESP18Q5W5W9 173 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUPD1Q68J44 220 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-3.03□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms