RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 ENKURQ8TC29 256 aa6.27□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 C2orf50Q96LR7 162 aa6.27□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RETNQ9HD89 108 aa6.27□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.27□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 AGRNO00468 2067 aa6.27□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SMCO3A2RU48 225 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM25EA8MYX2 175 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BP45 60 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 K7EPK0 472 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF688P0C7X2 276 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 PAX9P55771 341 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2F1Q13607 317 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB135Q30KP9 77 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 TEPPQ6URK8 271 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.26□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf66A4D0T2 115 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ISLRO14498 428 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 HYPMO75409 117 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMB3P49720 205 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 PLP1P60201 277 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RAP2BP61225 183 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB31Q13636 194 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMG4Q5JS54 123 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RARRES2Q99969 163 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF98A6NK75 572 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 GOSR2O14653 212 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RLN2P04090 185 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ORM2P19652 201 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 BCAP31P51572 246 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 IL15RAQ13261 267 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF124Q15973 351 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 LEMD1Q68G75 181 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF546Q86UE3 836 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 OR11H2Q8NH07 326 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.24□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CCSO14618 274 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-DRB4P13762 266 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 S100A11P31949 105 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CAV2P51636 162 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 HBG1P69891 147 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 HBG2P69892 147 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V1FQ16864 119 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 STX12Q86Y82 276 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 MFFQ9GZY8 342 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RPRMQ9NS64 109 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.23□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0J9YWU9 116 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 NUPR2A6NF83 97 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 KNCNA6PVL3 124 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BMM0 161 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 JTBO76095 146 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5G3P0C626 314 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00869P0C866 280 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SULT1A1P50225 295 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 Q6ZRG5 221 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 C16orf92Q96LL3 132 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00052Q96N35 136 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 RSG1Q9BU20 258 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 NMES1Q9C002 83 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A22Q9H936 323 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.22□□□□□ -1.41
MT-TS1-201ENST00000387416 LCE6AA0A183 80 aa6.21□□□□□ -1.42
MT-TS1-201ENST00000387416 E5RGE8 158 aa6.21□□□□□ -1.42
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