RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377027.1

C9orf85-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf85, Length 539 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf85-202ENST00000377027 A8MTW9 85 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf85-202ENST00000377027 SCGB2A1O75556 95 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf85-202ENST00000377027 PRM2P04554 102 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf85-202ENST00000377027 IL18Q14116 193 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf85-202ENST00000377027 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf85-202ENST00000377027 TRIM63Q969Q1 353 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-202ENST00000377027 PRRT1Q99946 306 aa6.75□□□□□ -1.33
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C9orf85-202ENST00000377027 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-202ENST00000377027 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-202ENST00000377027 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-202ENST00000377027 U3KQ87 197 aa6.75□□□□□ -1.33
C9orf85-202ENST00000377027 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.74□□□□□ -1.33
C9orf85-202ENST00000377027 A0A0J9YX75 114 aa6.74□□□□□ -1.33
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