RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364072.1

RNU6-501P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 501, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-501P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-501P-201ENST00000364072 DEFA3P59666 94 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 ROMO1P60602 79 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR52L1Q8NGH7 329 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 STAG3L4Q8TBR4 150 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM126AQ9H061 195 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PIK3C2GO75747 1445 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 CECR2Q9BXF3 1484 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 SMIM9A6NGZ8 99 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PDE6DO43924 150 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 LYPLA2O95372 231 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 RANP62826 216 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 EDDM3AQ14507 147 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PDZD9Q8IXQ8 264 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 LINC00467Q9BRT7 94 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRIM4Q9C037 500 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 GLTPQ9NZD2 209 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 OBSL1O75147 1896 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 MUC4Q99102 2169 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 RTL1A6NKG5 1358 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 ADCY9O60503 1353 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRAV10A0A0B4J240 114 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 CD2P06729 351 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 SRP14P37108 136 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPINK7P58062 85 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 HIST1H3AP68431 136 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 H3F3AP84243 136 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 AESQ08117 197 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR51A2Q8NGJ7 313 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PSMF1Q92530 271 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 LYSMD1Q96S90 227 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PCTPQ9UKL6 214 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 SCN8AQ9UQD0 1980 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 A8MWV9 139 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 B4DSR2 109 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 E7EUB6 86 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 RPS17P08708 135 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 LSM6P62312 80 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 C4orf22Q6V702 233 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 TET1Q8NFU7 2136 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR10K1Q8NGX5 313 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-501P-201ENST00000364072 NCOA1Q15788 1441 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 MYH7BA7E2Y1 1941 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARHGEF11O15085 1522 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 TNCP24821 2201 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 F8W1H4 67 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 H3BRM9 83 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 NDUFB3O43676 98 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 RPP14O95059 124 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 TCRBP04435 133 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 RRN3P1Q2M238 152 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 LYRM7Q5U5X0 104 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 C22orf39Q6P5X5 142 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 TEN1Q86WV5 123 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 LY96Q9Y6Y9 160 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 SIP14410 1827 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 NIPSNAP2O75323 286 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 HAND1O96004 215 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 PIGPP57054 158 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM97Q5BJF2 176 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR5D14Q8NGL3 314 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 Q8TAT8 98 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 CANT1Q8WVQ1 401 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 YPEL2Q96QA6 119 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM138Q9NPI0 162 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 TRAV4A0A0B4J268 109 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC144AA2RUR9 1427 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ERC2-IT1O76042 136 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZFYVE9O95405 1425 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ATOH7Q8N100 152 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR8J2Q8NGG1 315 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 PARVBQ9HBI1 364 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 MED29Q9NX70 200 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 FMN1Q68DA7 1419 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 A0A087WSZ3 146 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 COX7CP15954 63 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 SERPINB9P50453 376 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 CEBPGP53567 150 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 C1orf134Q5TEV5 83 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARL5BQ96KC2 179 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 RFX7Q2KHR2 1363 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 CXCL8P10145 99 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF137PP52743 207 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 OR10AC1Q8NH08 325 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms