RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360286.2

SUDS3-201, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SUDS3, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-201ENST00000360286 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 S100A10P60903 97 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 RAB11AP62491 216 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 VAMP2P63027 116 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 CD69Q07108 199 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ARL16Q0P5N6 197 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TIGITQ495A1 244 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 GPHB5Q86YW7 130 aa4.9□□□□□ -1.63
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SUDS3-201ENST00000360286 NPIPB3Q92617 1050 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 RAB40CQ96S21 281 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TXN2Q99757 166 aa4.9□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 NMES1Q9C002 83 aa4.9□□□□□ -1.63
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SUDS3-201ENST00000360286 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.9□□□□□ -1.63
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SUDS3-201ENST00000360286 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.89□□□□□ -1.63
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SUDS3-201ENST00000360286 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.89□□□□□ -1.63
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SUDS3-201ENST00000360286 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF546Q86UE3 836 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ACY3Q96HD9 319 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ATP6V0BQ99437 205 aa4.89□□□□□ -1.63
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SUDS3-201ENST00000360286 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.89□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 IGSF23A1L1A6 192 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 C2orf70A6NJV1 201 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 PRSS47A8MTI9 375 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 M0R143 59 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 LGALS9O00182 355 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 NDUFA4O00483 81 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 DEDDO75618 318 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 CST7O76096 145 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 YIF1AO95070 293 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 IGKV1-17P01599 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 CD5P06127 495 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 IGLC1P0CG04 106 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 OR10J1P30954 320 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 KRTAP10-11P60412 298 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 SLC35E1Q96K37 410 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 C20orf24Q9BUV8 137 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TREM1Q9NP99 234 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 NOTCH1P46531 2555 aa4.88□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 SORL1Q92673 2214 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM213A2RRL7 107 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 SMCO3A2RU48 225 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 CBLN1P23435 193 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 ZNF90Q03938 601 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.87□□□□□ -1.63
SUDS3-201ENST00000360286 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.87□□□□□ -1.63
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