RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 MGAQ8IWI9 3026 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 FAM231BA6NCW3 169 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 LEMD1Q68G75 181 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 CEP250Q9BV73 2442 aa14.54□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf70A6NJV1 201 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 IGLC1P0CG04 106 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ATOH7Q8N100 152 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TTC28Q96AY4 2481 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 H3BTX0 84 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 LYZP61626 148 aa14.53□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.52□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 ROS1P08922 2347 aa14.52□□□□□ -0.08
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00614P0C842 121 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PSG1P11464 419 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 RBPJQ06330 500 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 Q56UQ5 140 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.52□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 RBP4P02753 201 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 Q8NA96 180 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 B9A039 149 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 NPSP0C0P6 89 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TSPOP30536 169 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 I3L2K1 104 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TFPI2P48307 235 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 MAJINQ3KP22 176 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 RPEQ96AT9 228 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 FBXL15Q9H469 300 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP13Q12802 2813 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF292O60281 2723 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 COL8A1P27658 744 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 DLX1P56177 255 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 RNF5Q99942 180 aa14.5□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 STPG4Q8N801 248 aa14.49□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 C1RLQ9NZP8 487 aa14.49□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 IGLV2-11P01706 119 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CHEK1O14757 476 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 COX7A1P24310 79 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PLGLAQ15195 96 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 RNF24Q9Y225 148 aa14.48□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 LAMA5O15230 3695 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 HAX1O00165 279 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CD3EP07766 207 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PRNTQ86SH4 94 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 IGKV1-17P01599 117 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.47□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 KALRNO60229 2985 aa14.46□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 IGLL1P15814 213 aa14.46□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 PRR31Q5SQ13 230 aa14.46□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.46□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.46□□□□□ -0.09
SPNS3-201ENST00000355530 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.45□□□□□ -0.1
SPNS3-201ENST00000355530 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SPNS3-201ENST00000355530 LY6LH3BQJ8 138 aa14.45□□□□□ -0.1
SPNS3-201ENST00000355530 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms