RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324266.9

TRAPPC12-201, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC12, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC12-201ENST00000324266 J3KRW8 73 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 CT45A5P0DMU8 189 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC12-201ENST00000324266 CT45A7P0DMV0 189 aa14.62□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC12-201ENST00000324266 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC12-201ENST00000324266 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC12-201ENST00000324266 FAM168AQ92567 244 aa14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC12-201ENST00000324266 RNF183Q96D59 192 aa14.6□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC12-201ENST00000324266 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.59□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
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TRAPPC12-201ENST00000324266 CLEC3BP05452 202 aa14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC12-201ENST00000324266 RASL11AQ6T310 242 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC12-201ENST00000324266 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 ATP5G2Q06055 141 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 GPR82Q96P67 336 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC12-201ENST00000324266 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.57□□□□□ -0.08
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TRAPPC12-201ENST00000324266 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.56□□□□□ -0.08
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