RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ATMQ13315 3056 aa15.55■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.54■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 RAB4AP20338 218 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 PLXNB1O43157 2135 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 HIGD1CA8MV81 97 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 A8MWL6 223 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFA3O95167 84 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 PCP4P48539 62 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 ADORA2A-AS1P86434 159 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 LOC105371242A0A075B767 164 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PS18 150 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 PRTN3P24158 256 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 AMTP48728 403 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 ARF6P62330 175 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 S100A7AQ86SG5 101 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 CFHR4Q92496 578 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 RPH3ALQ9UNE2 315 aa15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 OR2J3O76001 311 aa15.52■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 SLAQ13239 276 aa15.52■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 K7EIM0 57 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1-17P01599 117 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 LEMD1Q68G75 181 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 ODF3BA8MYP8 253 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 P01737 135 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 NRN1Q9NPD7 142 aa15.51■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 C19orf71A6NCJ1 209 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 FAM231BA6NCW3 169 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 RCHY1Q96PM5 261 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GXF2 115 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 CD33P20138 364 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 LYPD1Q8N2G4 141 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 C18orf32Q8TCD1 76 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 VN1R17PQ8TDU5 208 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 VAMP8Q9BV40 100 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 OOSP1A8MZH6 123 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 CDKN1AP38936 164 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 FBXL7Q9UJT9 491 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 RAXQ9Y2V3 346 aa15.49■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 HBBP68871 147 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 SGK494Q96LW2 274 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 H3BRN7 92 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 KRTDAPP60985 99 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 Q86TA4 180 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 KIR3DL3Q8N743 410 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 OR4B1Q8NGF8 309 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.48■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 LY6HO94772 140 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 PMCHP20382 165 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 GDF5OSQ5U4N7 250 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 SVIPQ8NHG7 77 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 DIRC3C9JPN6 131 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 H3BTX0 84 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 M0R143 59 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 CDSNQ15517 529 aa15.47■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 TRBV19A0A075B6N1 114 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 HES1Q14469 280 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF562Q6V9R5 426 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 RNF125Q96EQ8 232 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 MIEN1Q9BRT3 115 aa15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SPNS1-201ENST00000311008 K7EQM0 130 aa15.45■□□□□ 0.06
SPNS1-201ENST00000311008 CAMPP49913 170 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms