RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 TOMM40O96008 361 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 TBR1Q16650 682 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PSPNO60542 156 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PAX9P55771 341 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 DUX3Q96PT4 197 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 THBDP07204 575 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PAX1P15863 534 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ORAOV1Q8WV07 137 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 C17orf100A8MU93 164 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 YPEL1O60688 119 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 CD33P20138 364 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 GCHFRP30047 84 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 YPEL2Q96QA6 119 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 NAV3Q8IVL0 2385 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 CD59P13987 128 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 NPIPB3Q92617 1050 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LRP4O75096 1905 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 EGR1P18146 543 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 CENPWQ5EE01 88 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PEX7O00628 323 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV4-39P01824 125 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 HBDP02042 147 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 CBLN1P23435 193 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 FAM90A2PQ658T7 463 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 C9orf106Q8NAJ2 232 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LINC01587Q99440 93 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ERG28Q9UKR5 140 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 EFNA4P52798 201 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 SNAI2O43623 268 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 SLC25A16P16260 332 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 AGMATQ9BSE5 352 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 GAGE13Q4V321 117 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LEAP2Q969E1 77 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF479Q96JC4 524 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PSCAO43653 123 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PPBPP02775 128 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 MORN2Q502X0 79 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 FBXL7Q9UJT9 491 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 PCNTO95613 3336 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ATP5G3P48201 142 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 CITED1Q99966 193 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 M0R2P5 195 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 TM4SF5O14894 197 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 OR52E5Q8NH55 327 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 SEC11AP67812 179 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 FOXF2Q12947 444 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 DTX1Q86Y01 620 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IL36BQ9NZH7 164 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV2-5P01817 119 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 LINC01559Q495D7 138 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRG-201ENST00000295874 IGKV1D-33P01593 117 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 IGKV1-33P01594 117 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 ESDP10768 282 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 ASCL2Q99929 193 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 ST20Q9HBF5 79 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 C21orf62Q9NYP8 219 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 A0A087WX48 190 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 DPM2O94777 84 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFA3O95167 84 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRG-201ENST00000295874 IGHV3-11P01762 117 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.4 ms