RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CD28P10747 220 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 RFNGQ9Y644 331 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA3Q8IXA5 215 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 FHL1Q13642 323 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD1Q8N2G4 141 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 D6R8Y8 96 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV40A0A0B4J280 105 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 PAX2Q02962 417 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 LILRA1O75019 489 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 EFNA4P52798 201 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 LYZL1Q6UWQ5 148 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM256Q8N2U0 113 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 GAFA1Q96PS6 74 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf139Q6ZV77 190 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV2A0A0B4J234 112 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF138P52744 262 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf64Q2M2E5 130 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 RPRMLQ8N4K4 120 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 NUP35Q8NFH5 326 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 LTBP1Q14766 1721 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRX2 142 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 BMPERQ8N8U9 685 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA1O95477 2261 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 RPL15P61313 204 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 SFTA2Q6UW10 78 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ACACAQ13085 2346 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 MPDZO75970 2070 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf24Q7Z6I8 188 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 KIR3DL3Q8N743 410 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JRQ6 117 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 PYY3Q5JQD4 70 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 NCOR1O75376 2440 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD5Q5TGI4 173 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A2PQ658T7 463 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 M0R1W7 72 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 IGHG3P01860 377 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZRM9 215 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF581Q9P0T4 197 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ROS1P08922 2347 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC9Q9Y336 463 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB1BP1O14713 200 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 DSCR9P59020 149 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 A8MWV9 139 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-201ENST00000284617 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 NCR2O95944 276 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 CRIM1Q9NZV1 1036 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 MALP21145 153 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf79P0CE67 100 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 CD33P20138 364 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 PSG3Q16557 428 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM95Q3KNT9 176 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ANK1P16157 1881 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00527Q9UJ94 153 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV4-39P01824 125 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ADCYAP1P18509 176 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A20O43772 301 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 HTN3P15516 51 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1GO43497 2377 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00477Q96M19 166 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM238C9JI98 176 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 GAGE13Q4V321 117 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM8BA6NDV4 472 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM40O96008 361 aa17.25■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf204Q6ZNR8 217 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF124Q15973 351 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ERG28Q9UKR5 140 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D1AO60880 128 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 GTSCR1Q86UQ5 136 aa17.24■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 DPH3P1Q9H4G8 78 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 GUSBP1Q15486 140 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SIGMAR1Q99720 223 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 KLRD1Q13241 179 aa17.23■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SRD5A1P18405 259 aa17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms