RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 H3BQ15 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 A6NNC1 897 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 J3QLI3 93 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFB4O95168 129 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 UBE2E1P51965 193 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RUNX1Q01196 453 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PET117Q6UWS5 81 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM50AO95807 157 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PAX9P55771 341 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00473A8K010 186 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TCF24Q7RTU0 167 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGLV1-47P01700 117 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-DRB1P01911 266 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 Q6ZRM9 215 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF114Q8NC26 417 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM160Q9NX00 188 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TREML4Q6UXN2 200 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MRAPQ8TCY5 172 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IMMP2LQ96T52 175 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 GPHA2Q96T91 129 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C15orf62A8K5M9 175 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 B4DSR2 109 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C22orf46C9J442 243 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 FOLR2P14207 255 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C12orf57Q99622 126 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 FXYD7P58549 80 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MED13Q9UHV7 2174 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM219Q86XT9 240 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 Q96MF0 132 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1B0GW15 77 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 NEUROG1Q92886 237 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C11orf52Q96A22 123 aa6.68□□□□□ -1.34
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PTPN3-201ENST00000262539 GCHFRP30047 84 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 Q6AWC8 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 A0A087WX48 190 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 H3BUA1 57 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RRHO14718 337 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 Q5PR19 223 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RNF223E7ERA6 249 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PLP1P60201 277 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 PSMG4Q5JS54 123 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 ZMAT4Q9H898 229 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 OR9G9P0C7N8 305 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CKS1BP61024 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-53P01767 116 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CRYBB3P26998 211 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 CST9LQ9H4G1 147 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 MST1LQ2TV78 715 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPN3-201ENST00000262539 A0A0G2JRQ6 117 aa6.66□□□□□ -1.34
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