RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.89□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.89□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ATP6V0E1O15342 81 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV2-5P01817 119 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR10AG1Q8NH19 301 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OVOL3O00110 214 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FBLN7Q53RD9 439 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 M0R143 59 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8NA96 180 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM101Q96IK0 257 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.88□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1B0GW15 77 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1W2PPI3 338 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR11H12B2RN74 326 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SYNJ2BPP57105 145 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DPH3Q96FX2 82 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC17A3O00476 420 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRORYQ9H606 182 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IL36BQ9NZH7 164 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DIRC3C9JPN6 131 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TCF21O43680 179 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDPQ00604 133 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.87□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IFITM10A6NMD0 228 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C22orf46C9J442 243 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV3-1P01715 115 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV2-70P01814 119 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 STAG3L2P0CL84 134 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 STAG3L3P0CL85 134 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRELID3AQ96N28 172 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.86□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PSMB2P49721 201 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WFDC1Q9HC57 220 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 J3QR89 54 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FGF16O43320 207 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CBLN1P23435 193 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NMUP48645 174 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C15orf62A8K5M9 175 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZRM9 215 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MGST2Q99735 147 aa9.85□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A0G2JRQ6 117 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 G3V318 75 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TOMM40O96008 361 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IL17RELQ6ZVW7 336 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HIGD1CA8MV81 97 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C15orf65H3BRN8 121 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MMP23AO75900 390 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV4-39P01824 125 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM70Q9BUB7 260 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.84□□□□□ -0.83
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CNTFRP26992 372 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FNDC10F2Z333 226 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CTSZQ9UBR2 303 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00587B1AMM8 73 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FCN3O75636 299 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ORMDL3Q8N138 153 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.82□□□□□ -0.84
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VSIRQ9H7M9 311 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms