RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PS18 150 aa21.04■□□□□ 0.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 BET1LQ9NYM9 111 aa21.04■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC105371242A0A075B767 164 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 F2Z2F3 143 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF503Q96F45 646 aa21.03■□□□□ 0.96
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.03■□□□□ 0.96
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CAPNS1-201ENST00000246533 CT45A7P0DMV0 189 aa20.95■□□□□ 0.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa20.94■□□□□ 0.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINK4O60575 86 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 NPSP0C0P6 89 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFB3P59826 476 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 C18orf32Q8TCD1 76 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TXN2Q99757 166 aa20.92■□□□□ 0.94
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