RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	LINC00205	P59089	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	KLRD1	Q13241	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	F8	P00451	2351 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	ODAM	A1E959	279 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	COX7A1	P24310	79 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM187	Q14656	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548		Q8WTZ3	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	P2RX4	Q99571	388 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TAAR5	O14804	337 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	MGST3	O14880	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	NDUFB8	O95169	186 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	HBZ	P02008	142 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	PI3	P19957	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	C4BPB	P20851	252 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	FXYD4	P59646	89 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	PEA15	Q15121	130 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	PTX4	Q96A99	478 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ARID1B-226	ENST00000637548		A0A096LNT2	108 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	PHOX2A	O14813	284 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	TNFSF12	O43508	249 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	NAPSA	O96009	420 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	ZBTB25	P24278	435 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	REG1B	P48304	166 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	INPP1	P49441	399 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548		Q6ZSV7	163 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	BUB3	O43684	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	JTB	O76095	146 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	IFNA1	P01562	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	RHOG	P84095	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ARID1B-226	ENST00000637548	BAX	Q07812	192 aa		4.08	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms