RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637032.2

SPTAN1-234, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-234ENST00000637032 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ARV1Q9H2C2 271 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RFNGQ9Y644 331 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 LINC01619G3V211 115 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 CCL24O00175 119 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 TOMM40O96008 361 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 LINC00869P0C866 280 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RPEL1Q2QD12 228 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 OR11H1Q8NG94 326 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 STOML3Q8TAV4 291 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ST8SIA2Q92186 375 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RAX2Q96IS3 184 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 DUX3Q96PT4 197 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 STAB1Q9NY15 2570 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ZNF320A2RRD8 509 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 NDUFA4O00483 81 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 TSPAN15O95858 294 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SPP1P10451 314 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ZP3P21754 424 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RIPPLY3P57055 190 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 B2MP61769 119 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PRR20EP86478 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PRR20CP86479 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PRR20DP86480 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PRR20BP86481 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PRR20AP86496 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 Q6ZRG5 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 GPHB5Q86YW7 130 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 STPG3Q8N7X2 389 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 HYPMO75409 117 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 IL4P05112 153 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 OR5G3P0C626 314 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SEC11BP0C7V7 166 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ORM2P19652 201 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 MYCNOSP40205 109 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SLURP1P55000 103 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SYNJ2BPP57105 145 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 LYZP61626 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SERF2P84101 59 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 TMED6Q8WW62 240 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RNF125Q96EQ8 232 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 MDFIQ99750 246 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 DOK5Q9P104 306 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-234ENST00000637032 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 COX7A2P2O60397 106 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 NPPCP23582 126 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 PLP1P60201 277 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 PATE2Q6UY27 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 C1QL4Q86Z23 238 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 OR4F4Q96R69 305 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 K7EMT4 169 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 LGALS9O00182 355 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 MBP02144 154 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 PF4P02776 101 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 M6PRP20645 277 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 RAB2AP61019 212 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 FHL3Q13643 280 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-234ENST00000637032 TM4SF20Q53R12 229 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms