RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609706.1

ANKRD54-212, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

Gene ANKRD54, Length 1,140 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-212ENST00000609706 RNF125Q96EQ8 232 aa11.56□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 MFFQ9GZY8 342 aa11.56□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 IFNA4P05014 189 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 VAMP1P23763 118 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 CCDC190Q86UF4 302 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 LRTM2Q8N967 370 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC35E1Q96K37 410 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 NRN1Q9NPD7 142 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 FBXL17Q9UF56 701 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 AGRNO00468 2067 aa11.55□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 IAPPP10997 89 aa11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 S100A5P33763 92 aa11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 GAMTQ14353 236 aa11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 ZFP92A6NM28 416 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 SFT2D2O95562 160 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 SLC25A6P12236 298 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF90Q03938 601 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 PPP1R1AQ13522 171 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 RAB40CQ96S21 281 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.53□□□□□ -0.56
ANKRD54-212ENST00000609706 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 SRRQ9GZT4 340 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 X6R8D5 127 aa11.52□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 MIFP14174 115 aa11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 LYZP61626 148 aa11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 HRH4Q9H3N8 390 aa11.51□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.5□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 RAB11AP62491 216 aa11.5□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 TRGV9Q99603 122 aa11.5□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.5□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 PRSS46E5RG02 174 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 MED6O75586 246 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 FABP1P07148 127 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 HOXB5P09067 269 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 HLA-DRB4P13762 266 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 OR2F1Q13607 317 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 THAP8Q8NA92 274 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.49□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 H3BMM0 161 aa11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 SOCS3O14543 225 aa11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 SYNGR2O43760 224 aa11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 DEDDO75618 318 aa11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.48□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 H3BP45 60 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 WRBO00258 174 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 NDUFB6O95139 128 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 DEFB1P60022 68 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 BAK1Q16611 211 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 TRIQKQ629K1 86 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 XCL2Q9UBD3 114 aa11.47□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 C9orf170A2RU37 121 aa11.46□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 C11orf94C9JXX5 98 aa11.46□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 ADAP1O75689 374 aa11.46□□□□□ -0.57
ANKRD54-212ENST00000609706 HLA-DMBP28068 263 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms