RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 IFNA1P01562 189 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 CD81P60033 236 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01006Q8NI28 216 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 P2RX4Q99571 388 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 GNG12Q9UBI6 72 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM89A2RUT3 159 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 F2RL2O00254 374 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 CGB3P0DN86 165 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 CGB7P0DN87 165 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 G6PCP35575 357 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF134P52741 427 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSM6Q6P461 480 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 ASCL2Q99929 193 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2D2Q9H210 308 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 TGP01266 2768 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 PHOX2AO14813 284 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 GNG7O60262 68 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 HBZP02008 142 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFA4P12838 97 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF152Q8N8N0 203 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 C15orf65H3BRN8 121 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 SELENOTP62341 195 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 HES1Q14469 280 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF114Q9Y508 228 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV1-47P01700 117 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 LGALS7P47929 136 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC00205P59089 165 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 SPINK9Q5DT21 86 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM12Q96EX1 92 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 DPM3Q9P2X0 92 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 NAT8Q9UHE5 227 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 J3QR06 171 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM23O14925 209 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXL1Q12952 345 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.96□□□□□ -0.81
RABGEF1-209ENST00000607882 S1PR2O95136 353 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4X1Q8NH49 305 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 RPEQ96AT9 228 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 KBTBD11O94819 623 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF7P21781 194 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 LOXL3P58215 753 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 BSXQ3C1V8 233 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4F5Q8NH21 305 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4F4Q96R69 305 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 PARLQ9H300 379 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMB3P49720 205 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 MOB3BQ86TA1 216 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 OR9G1Q8NH87 305 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TCF19Q9Y242 345 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 H7BYZ3 331 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TFPI2P48307 235 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 MSMO1Q15800 293 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 GALMQ96C23 342 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 SMCO3A2RU48 225 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 F8WDY8 70 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 CT45A1Q5HYN5 189 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 CT45A3Q8NHU0 189 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.5 ms