RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM23O14925 209 aa9.41□□□□□ -0.9
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.36□□□□□ -0.91
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV1-17P01599 117 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRIP30626 198 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDKN1AP38936 164 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLAQ13239 276 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LY6DQ14210 128 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASCL2Q99929 193 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPM3Q9P2X0 92 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NNC1 897 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VWC2LB2RUY7 222 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMPR1BO00238 502 aa9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.35□□□□□ -0.91
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