RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BLNKQ8WV28 456 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIRPDQ9H106 197 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EPDR1Q9UM22 224 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 K7EIM0 57 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RD3LP0DJH9 198 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EBI3Q14213 229 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNLZQ5SXM8 178 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAGE2Q86Y30 109 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GP9P14770 177 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00479Q96M42 142 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRBAP50851 2863 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PGPA6NDG6 321 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOX4O94842 621 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGKV1-17P01599 117 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2G1P62253 170 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COX19Q49B96 90 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q8N6K4 173 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARPC1AQ92747 370 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C19orf84I3L1E1 186 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMBPP02760 352 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CX3CL1P78423 397 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMIM12Q96EX1 92 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADMP35318 185 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2E1P51965 193 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM18Q96B42 140 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM11P17152 192 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CBLN1P23435 193 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR73Q6P4I2 378 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM68Q96MH6 324 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATG101Q9BSB4 218 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOMM40O96008 361 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM106CPP0CH98 169 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IER3P46695 156 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNG5P63218 68 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LEMD1Q68G75 181 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 S100A7AQ86SG5 101 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C1RLQ9NZP8 487 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF24Q9Y225 148 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MT-ND6P03923 174 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMO4P61968 165 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBLN7Q53RD9 439 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q9H3A6 140 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OVOL3O00110 214 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FMC1Q96HJ9 113 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 THYN1Q9P016 225 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNURFLB1AK76 121 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MFAP4P55083 255 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPR82Q96P67 336 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OTORQ9NRC9 128 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNG7O60262 68 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRS3P32247 399 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms