RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596941.5

GTPBP3-215, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 2

Gene GTPBP3, Length 678 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-215	ENST00000596941	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP3-215	ENST00000596941	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP3-215	ENST00000596941	RNF125	Q96EQ8	232 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP3-215	ENST00000596941	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	WRB	O00258	174 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	BUB3	O43684	328 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZNF90	Q03938	601 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	DHRS2	Q13268	280 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	PMS2P11	Q13670	270 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	HELT	A6NFD8	242 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	KNCN	A6PVL3	124 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	PRSS46	E5RG02	174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941		H3BP45	60 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	SYNGR2	O43760	224 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	MED6	O75586	246 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR4E1	P0C645	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB11A	P62491	216 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	CXorf65	A6NEN9	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	C4BPB	P20851	252 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR2F1	Q13607	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	STH	Q8IWL8	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	THAP8	Q8NA92	274 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	PLA2G10	O15496	165 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	LYZ	P61626	148 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	PSMG4	Q5JS54	123 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRGV9	Q99603	122 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	RARRES2	Q99969	163 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	NRN1	Q9NPD7	142 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	CENPX	A8MT69	81 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	JTB	O76095	146 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	ID3	Q02535	119 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-215	ENST00000596941	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		12.77	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SSSCA1	O60232	199 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	RAB40C	Q96S21	281 aa		12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFB4A	O15263	64 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	LYRM1	O43325	122 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCNK	O75909	580 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	FABP1	P07148	127 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SPP1	P10451	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	DEFB1	P60022	68 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	IFNA21	P01568	189 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	PAX9	P55771	341 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	AKR1C1	Q04828	323 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941		Q8NAQ8	132 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	MITD1	Q8WV92	249 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SOCS3	O14543	225 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SCGB1D2	O95969	90 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		12.73	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GTPBP3-215	ENST00000596941	CCS	O14618	274 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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