RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 SCGB2A1O75556 95 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV1-17P01599 117 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 IGHV3-11P01762 117 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SEC11BP0C7V7 166 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF90Q03938 601 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 MIC13Q5XKP0 118 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ATP6V0BQ99437 205 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 RNF114Q9Y508 228 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 IFNA7P01567 189 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 PROK1P58294 105 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SELENOTP62341 195 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 STPG3Q8N7X2 389 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 GNB4Q9HAV0 340 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 PPP5D1E7EU14 171 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TGOLN2O43493 480 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 YIF1AO95070 293 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TSPAN15O95858 294 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TRBV12-3P01733 135 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 CLEC3BP05452 202 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 FABP1P07148 127 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 CTSGP08311 255 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00869P0C866 280 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ARL3P36405 182 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 B2MP61769 119 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SERF2P84101 59 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF616Q08AN1 781 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 OR5B12Q96R08 314 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 A0A1B0GUS0 222 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TOMM40O96008 361 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 RD3LP0DJH9 198 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 CD28P10747 220 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 PSG1P11464 419 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SULT1A2P50226 295 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 RAB2AP61019 212 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 FAM209BQ5JX69 171 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 VSIRQ9H7M9 311 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 UMAD1C9J7I0 102 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 BMPR1BO00238 502 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 PAX4O43316 350 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 MBP02144 154 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 LYZP61626 148 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 Q6ZRG5 221 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 Q8WTZ3 238 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 DOK5Q9P104 306 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-209ENST00000592170 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-209ENST00000592170 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-209ENST00000592170 I3L521 148 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-209ENST00000592170 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-209ENST00000592170 OR2C1O95371 312 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-209ENST00000592170 M6PRP20645 277 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-209ENST00000592170 RAB5CP51148 216 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms