RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		A0A0J9YXV3	536 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PN81	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C2orf70	A6NJV1	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		J3QT63	122 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TNFSF12	O43508	249 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PITX3	O75364	302 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	MMP23A	O75900	390 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	NXPH3	O95157	252 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CDS2	O95674	445 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGLV2-14	P01704	120 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ATP6V0C	P27449	155 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CHRNA7	P36544	502 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	F2RL1	P55085	397 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TPPP2	P59282	170 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ERVK11-1	P61568	191 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	GNG3	P63215	75 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HLA-DRB3	P79483	266 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ID3	Q02535	119 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IL24	Q13007	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CLINT1	Q14677	625 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RPEL1	Q2QD12	228 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF585B	Q52M93	769 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	OR2C3	Q8N628	320 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PKIB	Q9C010	78 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PRELID1	Q9Y255	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		X6R8D5	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1B0GV50	99 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PPE3	182 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM210	A6NLX4	147 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SIRPB1	O00241	398 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	DEGS1	O15121	323 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SSSCA1	O60232	199 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CST7	O76096	145 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	S1PR2	O95136	353 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SNAPIN	O95295	136 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR2H2	O95918	312 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	F2R	P25116	425 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CAMLG	P49069	296 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PPT1	P50897	306 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PRRX1	P54821	245 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SRPX	P78539	464 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	PEA15	Q15121	130 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	HMGN3	Q15651	99 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	GUK1	Q16774	197 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZFP82	Q8N141	532 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	NEK7	Q8TDX7	302 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IL22RA2	Q969J5	263 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	YPEL4	Q96NS1	127 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CLCC1	Q96S66	551 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	OPA3	Q9H6K4	179 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	IFT22	Q9H7X7	185 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MSI2-216	ENST00000582772	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms