RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 PDCD5O14737 125 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RGS10O43665 173 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FCGR2CP31995 323 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RNF212Q495C1 297 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP82Q8N141 532 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 FAM210BQ96KR6 192 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM56Q96MV1 263 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 IFITM5A6NNB3 132 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 J3QL48 77 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 GNG7O60262 68 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MED6O75586 246 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SNAPC5O75971 98 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 RD3LP0DJH9 198 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 OR10A3P58181 314 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 FABP5Q01469 135 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 AADACL3Q5VUY0 350 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 OR1P1Q8NH06 330 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 OR51H1Q8NH63 302 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 C12orf57Q99622 126 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD9Q9P000 198 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NSG2Q9Y328 171 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1W2PS18 150 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM235A6NFC5 223 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 I3L2K1 104 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 K7EQG2 157 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MT-CO2P00403 227 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PPYP01298 95 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-48P01763 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF688P0C7X2 276 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 S100PP25815 95 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DMAP28067 261 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PPT1P50897 306 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 FXYD4P59646 89 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF546Q86UE3 836 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MOB3AQ96BX8 217 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 RAB40CQ96S21 281 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SCN3BQ9NY72 215 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0U1RRA0 63 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TCAPO15273 167 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PTHLHP12272 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 RAB3BP20337 219 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NPPCP23582 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MYL9P24844 172 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 EMP1P54849 157 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 VWC2Q2TAL6 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM17Q86X19 198 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 VCXQ9H320 206 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 XCL2Q9UBD3 114 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PRNDQ9UKY0 176 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM189A5PLL7 270 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 SCGNO76038 276 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 KRASP01116 189 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 HTN3P15516 51 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 G6PCP35575 357 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 LPAR6P43657 344 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 NPBWR1P48145 328 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 C6orf223Q8N319 242 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 BEST4Q8NFU0 473 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 ADAP1O75689 374 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-210ENST00000578916 F2RP25116 425 aa6.48□□□□□ -1.37
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