RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 BCAP31P51572 246 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HCCSP53701 268 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 WNT4P56705 351 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PAFAH1B2P68402 229 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZSCAN26Q16670 478 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB135Q30KP9 77 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ASCL4Q6XD76 172 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR5T1Q8NG75 326 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 NRBF2Q96F24 287 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SLC35E1Q96K37 410 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PRR34Q9NV39 138 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CKLFQ9UBR5 152 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 APLNQ9ULZ1 77 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CA2P00918 260 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINE2P07093 398 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HTR1AP08908 422 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MIFP14174 115 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF19P17023 458 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PSMB6P28072 239 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RHOGP84095 191 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PSG5Q15238 335 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RTL8BQ17RB0 113 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DHFR2Q86XF0 187 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 GAPTQ8N292 157 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR11H2Q8NH07 326 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR52E5Q8NH55 327 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 UBALD1Q8TB05 177 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 GNG8Q9UK08 70 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 H0YJW9 148 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SC5DO75845 299 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DCTN3O75935 186 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RAB3DO95716 219 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MAS1P04201 325 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 F2RP25116 425 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINB10P48595 397 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MUC4Q99102 2169 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DAPL1A0PJW8 107 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM189A5PLL7 270 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SMKR1H3BMG3 65 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 RTL8CO15255 209 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 C8orf88P0DMB2 117 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CT45A6P0DMU7 189 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CT45A5P0DMU8 189 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CT45A7P0DMV0 189 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 CTRB1P17538 263 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MAS1LP35410 378 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 NMUP48645 174 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MXD1Q05195 221 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 PIGYQ3MUY2 71 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 SYS1Q8N2H4 156 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.61□□□□□ -1.83
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