RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 CDKN1AP38936 164 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 LEPP41159 167 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TTC32Q5I0X7 151 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 F2Z2F3 143 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 MLNRO43193 412 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TFF1P04155 84 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PDLIM4P50479 330 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 COPS9Q8WXC6 57 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SIGMAR1Q99720 223 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 KLK15Q9H2R5 256 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TOMM40O96008 361 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 RAXQ9Y2V3 346 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01549A6NIU2 74 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 CGB1A6NKQ9 187 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TDGF1P13385 188 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PI4KAP42356 2102 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0G2JLM5 398 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GUS0 222 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ATP5G2Q06055 141 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 FAM27E3Q08E93 113 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF492Q9P255 531 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 V9GYV3 84 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 IGKCP01834 107 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ARPC1AQ92747 370 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 DPF1Q92782 380 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 METRNQ9UJH8 293 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 hDV102S1A0JD36 115 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ASIPP42127 132 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 Q0VFX4 171 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GWJ7 208 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 NBR2O15453 112 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 NPSP0C0P6 89 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 IGHV1-46P01743 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF329Q86UD4 541 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF479Q96JC4 524 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SP9P0CG40 484 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PRSS2P07478 247 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 VWC2Q2TAL6 325 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 H7C2G1 150 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A087X0K7 114 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 H0YJW9 148 aa8.48□□□□□ -1.05
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PTPRM-205ENST00000577827 MUC21Q5SSG8 566 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PROK2Q9HC23 129 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV3-15P01624 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 PSG1P11464 419 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 BSPH1Q075Z2 132 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRM-205ENST00000577827 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.47□□□□□ -1.05
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