RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	PPP5D1	E7EU14	171 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172		I3L521	148 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	OR2C1	O95371	312 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TSPAN15	O95858	294 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TOMM40	O96008	361 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	LINC00869	P0C866	280 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	SPP1	P10451	314 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	AWAT1	Q58HT5	328 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172		Q6ZRG5	221 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TMED6	Q8WW62	240 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	RFNG	Q9Y644	331 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		7.55	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	BMPR1B	O00238	502 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TRBV12-3	P01733	135 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	MB	P02144	154 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	KRTAP10-3	P60369	221 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	B2M	P61769	119 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TEX261	Q6UWH6	196 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	DPF1	Q92782	380 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.54	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	UMAD1	C9J7I0	102 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	HYPM	O75409	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	YIF1A	O95070	293 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	IFNA7	P01567	189 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	ZP3	P21754	424 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	RAB5C	P51148	216 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	PLP1	P60201	277 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	GPHB5	Q86YW7	130 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.53	□□□□□ -1.2
KLC1-223	ENST00000557172	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172		A0A087WW49	117 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172		A0A1W2PRX2	142 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	LINC01619	G3V211	115 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	NDUFA4	O00483	81 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	LCE2B	O14633	110 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	IL4	P05112	153 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR5G3	P0C626	314 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ORM2	P19652	201 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	M6PR	P20645	277 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	LYZ	P61626	148 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RPEL1	Q2QD12	228 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR11H1	Q8NG94	326 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	PFDN5	Q99471	154 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		7.52	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF320	A2RRD8	509 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	CCL24	O00175	119 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	COX7A2P2	O60397	106 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	S100A7	P31151	101 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	SULT1A2	P50226	295 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	IFITM2	Q01629	132 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	PATE2	Q6UY27	113 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RNF141	Q8WVD5	230 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KLC1-223	ENST00000557172	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.51	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms