RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555834.5

RPS6KL1-211, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, human

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 5,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KL1-211	ENST00000555834	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	FOXF2	Q12947	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PDLIM4	P50479	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834		F2Z2F3	143 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LAGE3	Q14657	143 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPS6KL1-211	ENST00000555834	UCN	P55089	124 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	GAGE2B	Q13066	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	GAGE2E	Q4V326	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PLAUR	Q03405	335 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	CD24	P25063	80 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	KIR3DS1	Q14943	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PRTN3	P24158	256 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	APC2	O95996	2303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PLN	P26678	52 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ERG28	Q9UKR5	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	CDKN1A	P38936	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ATP5J2	P56134	94 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TCRA	P04437	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	NTF4	P34130	210 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RPRML	Q8N4K4	120 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PSPN	O60542	156 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LINC01587	Q99440	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SPTA1	P02549	2419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ZNF138	P52744	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	PINLYP	A6NC86	204 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	HAX1	O00165	279 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834		A0A1B0GUS0	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	CD28	P10747	220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	MAJIN	Q3KP22	176 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	CD5L	O43866	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	CLPS	P04118	112 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ANK1	P16157	1881 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	RHOG	P84095	191 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834		M0R2P5	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	ATXN8	Q156A1	80 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	LINC00473	A8K010	186 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	FREM3	P0C091	2139 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	MYOD1	P15172	320 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834	TDGF1	P13385	188 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834		Q6ZRM9	215 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RPS6KL1-211	ENST00000555834		A0A0U1RRA0	63 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS6KL1-211	ENST00000555834	SELL	P14151	372 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS6KL1-211	ENST00000555834	GGN	Q86UU5	652 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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