RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555743.1

PSMA3-208, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-208	ENST00000555743	MED6	O75586	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TOMM40	O96008	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OR4E1	P0C645	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	NPPC	P23582	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OR10J1	P30954	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	DHRS2	Q13268	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	METTL26	Q96S19	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RBKS	Q9H477	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	HELT	A6NFD8	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	BUB3	O43684	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SYNGR2	O43760	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	YIF1A	O95070	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	NXPH3	O95157	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IFNA10	P01566	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RND2	P52198	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	APOC4	P55056	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TAS2R30	P59541	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	GAMT	Q14353	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743		Q8WTZ3	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RYR2	Q92736	4967 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SORL1	Q92673	2214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743		K7EPK0	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743		K7EQG2	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	LYRM1	O43325	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	FABP1	P07148	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68	1e-6	■□□□□ 8.8
PSMA3-208	ENST00000555743	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	INPP1	P49441	399 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RAB11A	P62491	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	ASAH1	Q13510	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RNF183	Q96D59	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TRGV9	Q99603	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TSC22D2	O75157	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IFNA21	P01568	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TCRB	P04435	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IFNA4	P05014	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	IL4	P05112	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	PSG1	P11464	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	LYL1	P12980	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	P2RY1	P47900	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA3-208	ENST00000555743	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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