RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF45	Q02386	682 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF79	Q15937	498 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570		Q56UQ5	140 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LRTM2	Q8N967	370 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR146	Q96CH1	333 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SRR	Q9GZT4	340 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1B0GW64	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	C15orf61	A6NNL5	157 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	YIF1A	O95070	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CDS2	O95674	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IFNA10	P01566	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IGKV1-5	P01602	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IL7	P13232	177 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CTRB1	P17538	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR183	P32249	361 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	RUNX1	Q01196	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	WT1-AS	Q06250	92 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM187	Q14656	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	OPCML	Q14982	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GUCA2B	Q16661	112 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LGI3	Q8N145	548 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	S100Z	Q8WXG8	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CXorf58	Q96LI9	332 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	AGRN	O00468	2067 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	LYRM1	O43325	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	GNG7	O60262	68 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	B3GALNT1	O75752	331 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SFT2D2	O95562	160 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	IFNA21	P01568	189 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	CRYGC	P07315	174 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SPN	P16150	400 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	UCP1	P25874	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	NPBWR1	P48145	328 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	SPCS3	P61009	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	PPP1R1A	Q13522	171 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATXN3-222	ENST00000553570	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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