RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553417.1

PRMT5-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-208	ENST00000553417	GAMT	Q14353	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	P2RY14	Q15391	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		A0A0J9YXV3	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	CORT	O00230	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	BUB3	O43684	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	KRAS	P01116	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	MYL12A	P19105	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	RHOB	P62745	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	QRFP	P83859	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	HES5	Q5TA89	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		H7BYZ3	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	G6PC	P35575	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	CBX5	P45973	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		Q6ZTI0	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	MEOX2	P50222	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ETV1	P50549	477 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		Q8N976	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	VCX	Q9H320	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		A8MTW9	85 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SOCS3	O14543	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PRAF2	O60831	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR10J1	P30954	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	PPT1	P50897	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR10A3	P58181	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	FXYD4	P59646	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SLA	Q13239	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	MSMO1	Q15800	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		Q6ZS49	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	C8orf4	Q9NR00	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417		E5RGE8	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PRMT5-208	ENST00000553417	DTYMK	P23919	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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