RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 CXCL1P09341 107 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 AKAIN1P0CW23 69 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 PGA4P0DJD7 388 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 PGA5P0DJD9 388 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 IGLC2P0DOY2 106 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 IGLC3P0DOY3 106 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 B4GALT1P15291 398 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF17P17021 662 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 FOXA1P55317 472 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 DLX6P56179 175 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 GINS1Q14691 196 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF146Q15072 292 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 NNATQ16517 81 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 Q6ZN92 141 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CMC1Q7Z7K0 106 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 RNF175Q8N4F7 328 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 DEFB125Q8N687 156 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR4L1Q8NH43 312 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 MUC7Q8TAX7 377 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SMIM19Q96E16 107 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TSSK2Q96PF2 358 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 DPY30Q9C005 99 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR51I2Q9H344 312 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ENY2Q9NPA8 101 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CA10Q9NS85 328 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 COMMD9Q9P000 198 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 THYN1Q9P016 225 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 B9D1Q9UPM9 204 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 WNK2Q9Y3S1 2297 aa3.7□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1B0GX51 115 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 A6NDN8 102 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 J3QLI3 93 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 M0R1B8 84 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 DCTN6O00399 190 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 HSBP1O75506 76 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 FCN3O75636 299 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 UBL3O95164 117 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 APOA2P02652 100 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 IGKV3-11P04433 115 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CT45A10P0DMU9 189 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 GP9P14770 177 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TSPOP30536 169 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CTRLP40313 264 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 PTGDSP41222 190 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 CRISP3P54108 245 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 MTCP1P56278 107 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TAS2R31P59538 309 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 PSG9Q00887 426 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SPHARQ15513 63 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF429Q86V71 674 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 C17orf64Q86WR6 236 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM123Q8N131 208 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 TEX29Q8N6K0 151 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR52E2Q8NGJ4 325 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR4X1Q8NH49 305 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 OR4A16Q8NH70 328 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 NT5CQ8TCD5 201 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 PPCDCQ96CD2 204 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF681Q96N22 645 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 GPER1Q99527 375 aa3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ATXN3-218ENST00000553309 EBPLQ9BY08 206 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms