RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 FA2HQ7L5A8 372 aa6.38□□□□□ -1.39
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SENP1-210ENST00000552189 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.34□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ID3Q02535 119 aa6.34□□□□□ -1.39
SENP1-210ENST00000552189 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.34□□□□□ -1.39
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SENP1-210ENST00000552189 GCGP01275 180 aa6.34□□□□□ -1.4
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SENP1-210ENST00000552189 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 NAT8Q9UHE5 227 aa6.34□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.33□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 EML5Q05BV3 1969 aa6.33□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 ZNF345Q14585 488 aa6.33□□□□□ -1.4
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