RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 NPIPB3Q92617 1050 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 MOSP00540 346 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PRCDQ00LT1 54 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PATE2Q6UY27 113 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CGB3P0DN86 165 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CGB7P0DN87 165 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SELENOVP59797 346 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ORM2P19652 201 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CA7P43166 264 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 DLX1P56177 255 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 TCTAP57738 103 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FOXE3Q13461 319 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 LOC105371242A0A075B767 164 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CCL3L1P16619 93 aa11.47□□□□□ -0.57
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PRAME-214ENST00000543184 MPV17L2Q567V2 206 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PAXXQ9BUH6 204 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SPG11Q96JI7 2443 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 C2orf70A6NJV1 201 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SNAI2O43623 268 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 COX7A2P2O60397 106 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CD69Q07108 199 aa11.46□□□□□ -0.57
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PRAME-214ENST00000543184 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 MBD6Q96DN6 1003 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PRRG2O14669 202 aa11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 UBE2G1P62253 170 aa11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 RBX1P62877 108 aa11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 CORO2AQ92828 525 aa11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 PRNDQ9UKY0 176 aa11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 COX11Q9Y6N1 276 aa11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 A0A1W2PRE2 83 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 PEX7O00628 323 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 KIR2DS2P43631 304 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 HARBI1Q96MB7 349 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 TPSG1Q9NRR2 321 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 BET1LQ9NYM9 111 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-214ENST00000543184 CBY3A6NI87 242 aa11.45□□□□□ -0.58
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PRAME-214ENST00000543184 OR5B3Q8NH48 314 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 RITA1Q96K30 269 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 BPIFB3P59826 476 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 WT1-ASQ06250 92 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 VAMP3Q15836 100 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 PGPA6NDG6 321 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 UBE2V1Q13404 147 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 COTL1Q14019 142 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 CDSNQ15517 529 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 TENM4Q6N022 2769 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 OR4C46A6NHA9 309 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-214ENST00000543184 GNLYP22749 145 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 CCL8P80075 99 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 CR1LQ2VPA4 569 aa11.44□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 SSX8Q7RTT4 187 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-214ENST00000543184 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.44□□□□□ -0.58
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PRAME-214ENST00000543184 GUSBP1Q15486 140 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 GAFA1Q96PS6 74 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 CGB1A6NKQ9 187 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 H0YJW9 148 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 RTL8BQ17RB0 113 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 FBLN7Q53RD9 439 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-214ENST00000543184 C2orf83Q53S99 150 aa11.43□□□□□ -0.58
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