RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MED13Q9UHV7 2174 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 hDV102S1A0JD36 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SPRNQ5BIV9 151 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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CS-202ENST00000542324 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CGB1A6NKQ9 187 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 K7ERU9 68 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 SPRY3O43610 288 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TCRAP04437 139 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-202ENST00000542324 GP9P14770 177 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 WT1-ASQ06250 92 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.48□□□□□ -1.05
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CS-202ENST00000542324 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 Q86TA4 180 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OTORQ9NRC9 128 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 OR2T8A6NH00 312 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PSG1P11464 419 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 PSG9Q00887 426 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 RIGQ13278 110 aa8.47□□□□□ -1.05
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CS-202ENST00000542324 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TMEM186Q96B77 213 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CCL13Q99616 98 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 VPS25Q9BRG1 176 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 Q9H3A6 140 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 CACNA1BQ00975 2339 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 USP34Q70CQ2 3546 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-202ENST00000542324 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 CSN1S1P47710 185 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 ZNF137PP52743 207 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 ARF6P62330 175 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 FAM201AQ5SY85 155 aa8.46□□□□□ -1.06
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CS-202ENST00000542324 Q6AWC8 147 aa8.46□□□□□ -1.06
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CS-202ENST00000542324 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 RND1Q92730 232 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 E7EUB6 86 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 M0QZ24 198 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 M0R1B8 84 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 IGLV2-23P01705 113 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 IGHV1-46P01743 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 COL8A1P27658 744 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 BLNKQ8WV28 456 aa8.45□□□□□ -1.06
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CS-202ENST00000542324 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 A0A1B0GUT8 65 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 CBY3A6NI87 242 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 IGLC1P0CG04 106 aa8.45□□□□□ -1.06
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CS-202ENST00000542324 MC5RP33032 325 aa8.45□□□□□ -1.06
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CS-202ENST00000542324 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 ZNF747Q9BV97 191 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 RNF24Q9Y225 148 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PPI3 338 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 OVOL3O00110 214 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 FAM87AP0C7U9 286 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 ORM2P19652 201 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 CEACAM3P40198 252 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 LGALS7P47929 136 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-202ENST00000542324 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.44□□□□□ -1.06
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