RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 APLNQ9ULZ1 77 aa8.54□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 HELTA6NFD8 242 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 SPP1P10451 314 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF90Q03938 601 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF79Q15937 498 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 LGI3Q8N145 548 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.53□□□□□ -1.04
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CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 MCUBQ9NWR8 336 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXL17Q9UF56 701 aa8.53□□□□□ -1.04
CLSTN3-211ENST00000541667 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.53□□□□□ -1.04
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CLSTN3-211ENST00000541667 IFNA10P01566 189 aa8.52□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 MIFP14174 115 aa8.52□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB1P60022 68 aa8.52□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 LRTM2Q8N967 370 aa8.52□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 MCFD2Q8NI22 146 aa8.52□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 C17orf77Q96MU5 243 aa8.52□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.51□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.51□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.51□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF125Q96EQ8 232 aa8.51□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 NRN1Q9NPD7 142 aa8.51□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 CELA1Q9UNI1 258 aa8.5□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.49□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2F1Q13607 317 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.47□□□□□ -1.05
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CLSTN3-211ENST00000541667 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ID3Q02535 119 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 BAK1Q16611 211 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.46□□□□□ -1.06
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.46□□□□□ -1.06
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