RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 BMPR1BO00238 502 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 OR2C1O95371 312 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 IFNA7P01567 189 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TRBV12-3P01733 135 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 LINC00869P0C866 280 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PSG1P11464 419 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ZP3P21754 424 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RPEL1Q2QD12 228 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TMED6Q8WW62 240 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 DPF1Q92782 380 aa9.23□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 NF1P21359 2839 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PRX2 142 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 LINC01619G3V211 115 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 NDUFA4O00483 81 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 M6PRP20645 277 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 S100A7P31151 101 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PLP1P60201 277 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 LYZP61626 148 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TEX261Q6UWH6 196 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 S100A7AQ86SG5 101 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 RNF125Q96EQ8 232 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PFDN5Q99471 154 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 JMJD1CQ15652 2540 aa9.22□□□□□ -0.93
LMO3-218ENST00000538020 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 A0A087WW49 117 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 COX7A2P2O60397 106 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 HYPMO75409 117 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 YIF1AO95070 293 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 IL4P05112 153 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RAB5CP51148 216 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 KRTAP10-3P60369 221 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 GPHB5Q86YW7 130 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR11H1Q8NG94 326 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR1N2Q8NGR9 330 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RNF2Q99496 336 aa9.21□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR5G3P0C626 314 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ORM2P19652 201 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 SULT1A2P50226 295 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 DEFB136Q30KP8 78 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 CITED1Q99966 193 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 DOK5Q9P104 306 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 UBQLN2Q9UHD9 624 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RABAC1Q9UI14 185 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RNF24Q9Y225 148 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RFNGQ9Y644 331 aa9.2□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 CCL24O00175 119 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RHOBP62745 196 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 REC114Q7Z4M0 266 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 C1QL4Q86Z23 238 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RNF141Q8WVD5 230 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ZNF747Q9BV97 191 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.19□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PPV4 95 aa9.18□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 ZNF320A2RRD8 509 aa9.18□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 LGALS9O00182 355 aa9.18□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 RAB2AP61019 212 aa9.18□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 FHL3Q13643 280 aa9.18□□□□□ -0.94
LMO3-218ENST00000538020 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms