RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	UPK3B	Q9BT76	320 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263		Q9H3A6	140 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
VIRMA-208	ENST00000523263	ISLR	O14498	428 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	B3GALNT1	O75752	331 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	NUDT3	O95989	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ATP5G1	P05496	136 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ATP5G3	P48201	142 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	AKR1C2	P52895	323 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	XG	P55808	180 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	LINC01559	Q495D7	138 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM78B	Q5VT40	261 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	AMTN	Q6UX39	209 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	SSX7	Q7RTT5	188 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	NOXA1	Q86UR1	476 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM219A	Q8IW50	185 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	SPART	Q8N0X7	666 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	GPX8	Q8TED1	209 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	NRG4	Q8WWG1	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF503	Q96F45	646 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	LINC00052	Q96N35	136 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ABHD1	Q96SE0	405 aa		6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		F5H768	121 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		M0QYG6	137 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	NXPH3	O95157	252 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	PSG1	P11464	419 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	DEFB1	P60022	68 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	COQ8A	Q8NI60	647 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RNF141	Q8WVD5	230 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RNF125	Q96EQ8	232 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	TP53RK	Q96S44	253 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RPRM	Q9NS64	109 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		6.57	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	UCP1	P25874	307 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	MEOX2	P50222	304 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CLINT1	Q14677	625 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		Q5VSD8	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	FRZB	Q92765	325 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	DOK5	Q9P104	306 aa		6.56	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		A0A0G2JRQ6	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		F6UB75	175 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	DEFB130B	P0DP73	79 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	DEFB130A	P0DP74	79 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RCVRN	P35243	200 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	PIGP	P57054	158 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	GPR146	Q96CH1	333 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CNBD2	Q96M20	576 aa		6.55	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		H3BNG1	76 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CDS2	O95674	445 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	INS	P01308	110 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	PGAM2	P15259	253 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	NMS	Q5H8A3	153 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	GPR141	Q7Z602	305 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	VCX3B	Q9H321	246 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	RAB26	Q9ULW5	256 aa		6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	FABP1	P07148	127 aa		6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.53	□□□□□ -1.36
VIRMA-208	ENST00000523263	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		6.53	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms