RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.9□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF292O60281 2723 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV2-14P01704 120 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MFAP2P55001 183 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FOXI1Q12951 378 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 A0A1B0GXF2 115 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 LYZL6O75951 148 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 OPRK1P41145 380 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 EDDM3BP56851 147 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TMPRSS3P57727 454 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CATR1Q13166 79 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TIGITQ495A1 244 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 NUP35Q8NFH5 326 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 Q8TCH9 128 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM168AQ92567 244 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DS4P43632 304 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GNG3P63215 75 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DS1Q14954 304 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PIP4P1Q86T03 277 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 H3BMG7 143 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TAS2R45P59539 299 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ADIPOQQ15848 244 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D28Q2M2D7 210 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TRIB1Q96RU8 372 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CACNA1GO43497 2377 aa6.88□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 MPDU1O75352 247 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1-2P23083 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 RTL8BQ17RB0 113 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZS92 163 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE12JA6NER3 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 M0QXV9 152 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE7O76087 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 APOMO95445 188 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 P0C879 139 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE12FP0CL80 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE12GP0CL81 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE12IP0CL82 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FXYD2P54710 66 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE4Q13068 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE13Q4V321 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FGFRL1Q8N441 504 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CEP250Q9BV73 2442 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZR03 302 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.87□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 AKAP13Q12802 2813 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 SRD5A1P18405 259 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TCTAP57738 103 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 C5orf47Q569G3 176 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 WDR86Q86TI4 376 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF747Q9BV97 191 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 SPTBN2O15020 2390 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 B9A039 149 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 ZG16O60844 167 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 NCR2O95944 276 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.86□□□□□ -1.31
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms